Estudio de diversidad en variedades de uva de mesa ("Vitis vinifera" L.) y su aplicación al análisis de asociación para caracteres de calidad

Abstract

La finalidad de este trabajo es contribuir al conocimiento de los recursos genéticos como herramienta para la mejora de la calidad en la uva de mesa. Para alcanzar este objetivo se planteó como punto de partida la caracterización y evaluación de la variabilidad de los recursos fitogenéticos de uva de mesa que existen en la Colección de Variedades de Vid de la Finca El Encín (IMIDRA). Dicha caracterización constó de un estudio morfológico, en el que se describieron 48 caracteres en 406 accesiones, y de un estudio molecular, en el que se analizaron 352 accesiones mediante 20 marcadores microsatélite. Ambos estudios permitieron identificar 35 posibles sinonimias, 16 posibles sports (mutantes somáticos) y 24 posibles errores de banco, de los cuales 12 posibles sinonimias y 6 posibles sports no habían sido previamente descritos. Asimismo, se estudiaron 93 posibles pedigríes: se confirmaron 54 pedigríes descritos en la bibliografía, aportándose nueva información acerca de la dirección de los cruzamientos, desconocida para la mayoría de ellos; se detectaron 24 pedigríes nuevos o cuya descripción era incompleta en la bibliografía; y se detectaron 20 variedades con posibles errores bibliográficos en su pedigrí, proponiéndose los posibles verdaderos progenitores de 15 de ellas. Una vez evaluada dicha colección, se llevó a cabo un estudio de asociación para evaluar la posible implicación de determinados genes candidatos en caracteres de interés agronómico y comercial. Para la consecución de este estudio se construyeron dos colecciones nucleares, se analizó su estructura genética y se realizaron análisis de desequilibrio de ligamiento, de selección y de estructura proteica. Se detectaron asociaciones significativas entre determinados SNPs en el gen VvGAI1 y la época de madurez y la textura de la baya, y entre determinados SNPs en el gen VvPel y la textura de la baya y la longitud del racimo.