Diseño y predicción de promotores específicos de neuroblastoma

Abstract

El neuroblastoma es una enfermedad infantil caracterizada por el desarrollo de tumores a partir de células cancerígenas del tejido nervioso de las glándulas suprarrenales. Existen marcadores genéticos para caracterizar, clasificar y diagnosticar este tipo de tumores. Un ejemplo de estos marcadores es la amplificación de MYCN, frecuentemente utilizada como herramienta de pronóstico. A pesar de los tratamientos disponibles actualmente, el neuroblastoma es un tipo de cáncer que sigue estando caracterizado por una alta mortalidad. Por este motivo, es necesario el desarrollo de nuevas terapias que dirijan su acción específicamente a este tipo de células tumorales, maximizando su actividad en el tejido diana y reduciendo su toxicidad en otros tejidos. Un ejemplo de este tipo de terapia podría ser la edición génica. Para lograr una expresión específica en un tejido determinado, la expresión de genes terapéuticos debe estar controlada por promotores específicos de ese tejido. Para ello se deben analizar las secuencias promotoras que regulan la transcripción de genes cuya expresión sea restringida a neuroblastoma. Sin embargo, estas secuencias promotoras abarcan grandes regiones de ADN, y los vectores utilizados en terapia génica solamente pueden incorporar secuencias de un tamaño limitado. Por esta razón, se deben seleccionar los fragmentos esenciales que garantizan el funcionamiento del promotor. En este trabajo, se realiza un análisis y predicción de las secuencias fundamentales de cuatro promotores de proteínas expresadas diferencialmente en neuroblastoma para, posteriormente, evaluar su actividad mediante la medida de la expresión de una proteína reportera